
時間:2020-07-20 14:40:00 瀏覽:3979次
一、lncRNA芯片
長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,
lncRNA) 指的是長度在200-100000
nt之間的RNA分子,它們不編碼蛋白,但參與細胞內多種過程調控。人們對lncRNA的認識還處在初級階段,lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉錄的副產物,不具有生物學功能。然而,近年來的研究表明,lncRNA參與了X染色體沉默、基因組印記以及染色質修飾、轉錄激活、轉錄干擾、核內運輸等多種重要的調控過程,與人類疾病的發生、發展和防治都有著密切的關系。lncRNA的種類遠遠超過編碼RNA,哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產生的轉錄本是lncRNA(相應的蛋白編碼RNA的比例是1%-5%)。lncRNA已經成為非編碼RNA研究領域的一個熱點。
lncRNA研究的重要一步是發現與特定疾病相關的lncRNA。傳統的lncRNA篩選方法(SELEX等)效率低下,假陽性率高。而基因芯片具有覆蓋全面、高效、準確的特點,因此用基因芯片來篩選lncRNA是一種準確快捷的方法。
二、lncRNA技術特點:
1)目前市面上探針密度最高的lncRNA芯片產品;
2)芯片采用Agilent
eArray平臺設計,使用Agilent
SurePrint技術合成,技術重復性高于99%;
3)覆蓋主流數據庫所有lncRNA,可同時檢測lncRNA和mRNA,并挖掘兩者之間的關聯;
4)檢出率高:隨機引物擴增方式,可同時擴增帶Ploy-A和不帶Poly-A的lncRNA,確保更多的
lncRNA被檢測出來;
5)提供完整lncRNA芯片數據分析解決方案。
三、lncRNA芯片服務流程:
1、總RNA提??;
2、反轉錄合成cDNA;
3、體外轉錄合成cRNA;
4、隨機引物合成正義鏈cDNA
5、DNA片段化,生物素標記;
6、芯片雜交、洗滌、染色、掃描。
四、樣本要求:細胞、新鮮組織或總RNA樣品
1、提取RNA量≥1ug;
2、細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)直接液氮凍存后,-80℃保存。
3、樣品運輸:細胞或者組織樣品;或者總RNA樣本置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運輸。
五、應用:
篩選差異表達的lncRNA和mRNA、lncRNA功能注釋、lncRNA調控機制預測
六、服務流程
七、服務項目
分子生物學類 | 蛋白質與免疫學 | 動物實驗 |
實時熒光定量PCR | 單克隆抗體制備 | 帕金森疾病模型 |
免疫共沉淀(Co-IP) | 多克隆抗體制備 | 抑郁癥動物模型 |
ELISA(酶聯免疫吸附法)技術 | Western-blot 實驗服務 | 脊髓損傷模型 |
生化指標檢測 | 蛋白雙向電泳實驗服務 | 腦外損傷模型 |
雙熒光素酶報告基因檢測 | 原核蛋白表達純化 | 骨神經損傷模型 |
染色質免疫共沉淀(ChIP) | 真核蛋白表達純化 | 心肌缺血模型 |
GST pull Down | ITRAQ定量蛋白質組學 | 心力衰竭模型 |
SLAC蛋白組學 | 肺動脈高血壓動物模型 | |
高血壓模型 | ||
病毒類 | 實驗課題整體外包 | 粥樣動脈硬化模型 |
過表達/干擾慢病毒包裝純化 | 整體課題外包 | 大腦中動脈阻塞模型 |
過表達/干擾腺病毒包裝純化 | 細胞整體實驗外包 | 慢性之氣管炎模型 |
逆轉錄病毒包裝純化 | 動物整體實驗外包 | 過敏性哮喘模型 |
腺相關病毒包裝純化 | 肺炎大鼠模型 | |
肝炎-肝硬化-肝癌模型 | ||
蛋白芯片 | 原代細胞培養 | 肝纖維化模型 |
細胞因子芯片 | 骨髓間充質干細胞培養 | 膽結石模型 |
生長因子芯片 | 脂肪干細胞培養 | 急性胰腺炎模型 |
信號通路磷酸化水平檢測芯片 | 心肌成纖維細胞培養 | 急性腎衰竭模型 |
BioPlex懸浮芯片 | 軟骨細胞培養 | 體內血栓模型 |
生長因子芯片 | 血管內皮細胞培養 | 關節炎模型 |
炎癥因子芯片 | 神經元細胞培養 | I型和II型糖尿病模型 |
血管生成因子芯片 | 內皮組細胞原代培養 | 裸鼠成瘤 |
凋亡因子芯片 | 基因編輯動物 | |
趨化因子芯片 | 電生理相關服務 | 動物整體實驗服務 |
HuProt TM 20K人類蛋白組芯片 | 膜片鉗實驗 | |
細胞生物學 | 高通量測序 | 代謝組學 |
細胞原代培養 | mRNA測序 | 氣相色譜GC/MS |
MTT檢測 | LncRNA測序 | 液相色譜LC/MS |
細胞凋亡檢測 | 全基因組測序 | 核磁共震NMR |
細胞周期檢測 | RNA-Seq測序 | |
細胞克隆形成實驗 | 外顯子測序 | 影像學相關實驗 |
Transwell細胞遷移/侵襲 | 16s擴增子測序 | Micro-CT |
流式分選 | Small RNA測序 | 小動物活體成像 |
CCK8/XTT檢測 | 宏基因組測序 | 核磁共振 |
臺盼藍檢測細胞活性 | 單細胞測序 | PET-CT |
藥物篩選細胞學實驗 | circleRNA測序 | |
細胞粘附性檢測 | 甲基化測序 | 基因編輯動物 |
細胞劃痕實驗 | 條件性敲除小鼠/大鼠 | |
細胞生物學整體實驗 | 全基因敲除小鼠/大鼠 | |
細胞成管實驗 | ||
病理類 | CRISPR/Cas9細胞敲除/敲入 | 基因芯片 |
掃描電鏡 | 基因定點突變細胞系 | LncRNA芯片 |
透射電鏡 | 單基因敲除細胞系 | miRNA芯片 |
HE染色 | 多基因敲除細胞系 | mRNA芯片 |
免疫組化 | 目的基因敲入細胞系 | 甲基化芯片(限人和小鼠來源樣本) |
Tunel(原位末端凋亡法)檢測 | 報告基因敲入細胞系 | SNP芯片(限人和小鼠來源樣本) |
激光共聚焦 | miRNA/LncRNA敲除細胞系 | |
免疫熒光 | ||
Masson染色 | CRISPR/Cas9動物敲除/敲入 |
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原位雜交 | 基因敲除大鼠/小鼠 | |
熒光原位雜交 | 基因敲入大鼠/小鼠 |
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特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍等) |
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行為學檢測 | 藥物篩選服務項目 | 藥效學評價 |
水迷宮實驗 | 高通量自動藥物篩選平臺 | 神經系統藥物藥效學評價 |
曠場實驗 | 細胞高內涵藥物篩選平臺 | 抗腫瘤藥物藥效學評價 |
重復性刻板行為檢測 | 蛋白質組學靶標研發平臺 | 心血管系統藥物藥效學評價 |
動物跑臺檢測 | 分子藥理研究平臺 | 泌尿系統藥物藥效學評價 |
強迫游泳 | 生物膜片鉗藥物篩選平臺 | 內分泌系統藥物藥效學評價 |
常規藥物體外篩選 | 抗炎免疫藥物藥效學評價 |
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分子生物學、細胞生物學、病理染色檢測、細胞敲除&敲入、模式與轉基因動物、SPF動物保種、免疫學檢測、影像學檢測、原代培養、細胞藥篩、CRISPR/Cas9基因編輯、基因芯片、高通量測序、蛋白組學、代謝組學、高通量高內涵篩選、藥效學評價、藥理毒理學實驗、慢病毒包裝與穩轉株建立、SiRNA與納米載藥、ChIP、CO-IP、生物信息學分析、知識產權服務!
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